近年来，中央和地方持续加大“三农”投入力度，聚焦农田基础设施建设，从根本上扭转了农田水利建设滞后的局面，但其运行管护中暴露出的问题也日益突出，亟待加以解决。
一是基础设施老化。由于绝大多数农田水利基础设施兴建于上世纪50~70年代，受当时条件制约，建设标准低、配套不完善，基础设施运行年久，维修经费不足，地方财政无力承担更新改造费用，导致损坏严重。
二是管理体制僵化。普遍存在“重建轻管”现象，一些地方水利建设积极性很高，却因维修无经费、产权不明晰及缺乏激励机制等方面原因疏于管理，经营粗放，特别是一些小型水利工程长期处于无管理机构、无管理人员、无管理经费的“三无”状态，造成水利设施管护困难。
三是管护队伍弱化。现有乡镇水利员大都身兼多职，难以顾及水利工作，大部分村没有负责农村水利设施管理的人员，加上农田基础设施是公共产品，村民很少有足够的动力去自觉维护，致使部分农田基础水利设施处于“农民管不了、集体管不好、政府管不到”的“三不管”境地。
为此，笔者建议地方政府要高度重视农田水利基础设施管护工作。
一是拓宽筹资渠道，强化经费保障。积极调整现有农业补贴政策，把抗旱、节水灌溉等农业基础设施建设管护中的机械设备纳入补贴范畴，补贴调整应向农业基础设施建设和养护倾斜；深化农村投融资体制改革，加快建立社会资本参与的激励机制，积极鼓励社会资本和农民筹资建设管理农田基础设施建设。
二是明确责任主体，强化长效机制。明确农田水利基础设施管护责任主体和管护责任，保证设施正常运转；建立群管为主、专管为辅、专群结合的新型农田水利基础设施服务体系网络；建立管护标准和管护目标考核制度，把工程管护与工资效益挂钩。
三是创新管理模式，强化管护措施。对建成的农田水利等公益性基础设施，可将管护责任落实给直接受益的种粮农民协会和农业合作社，或直接将工程按投资额折成股份入股给合作社，使其成为参与合作农民的集体资产，发挥农民群众主体作用，确保工程长久发挥效益。
