草甘膦的神话开始于1974年，一经投入市场即可俘虏了全世界农民的真心。在风雨飘摇的2015年，时年41岁的草甘膦达成了45.75亿美元的全球市场销售额，而2015年全球农药市场的销售总额大约在500亿美元左右。对于外贸企业而言，草甘膦更是首屈一指的龙头产品，位列当年农药出口第一名。
草甘膦的崛起以及为期40年的经久不衰，在农药领域堪称神话，然而，它毕竟不年轻了，一个广泛使用了41年的除草剂必然面对的困境就是——抗药性。要知道，单一作用机制除草剂的大量连续使用，一般3-5年就容易使杂草产生抗药性。
草甘膦从诞生之初就不是见佛杀佛的除草剂，相当一部分杂草对它具有天然耐性。新农药创制与开发国家重点实验室、沈阳中化农药化工研发有限公司教授级高级工程师刘长令在第八届世界农药科技与应用发展学会交流会上向与会者介绍了草甘膦的作用机理，就草甘膦的抗性展开阐述。
对草甘膦具有天然抗性的杂草有如下几种：
茴麻、水苋、蔾、竹节花、白酒草、铁荸荠、马唐、番薯、地肤、蓼、弗罗里达马蹄莲、费氏狗尾草、大果田菁、繁缕、龙葵。
如果种植的作物，伴生着这些杂草，放弃用草甘膦吧——免耕、一网打尽、见绿就杀，草甘膦的法宝纷纷折戟沉沙。
在41年的发展过程中，更多的曾经在草甘膦面前不堪一击的“娇弱”杂草进化成功，让草甘膦无可奈何。代表性杂草即通泉草、鸭跖草、黄鹌菜、马齿苋、鼠曲草、铁苋菜、田旋花、苣荬菜等等，其共性在于对草甘膦非常不敏感，耐药性强，单一使用草甘膦不能有效防除。我国分别于2006年、2010年报道了小飞蓬、牛筋草对草甘膦产生抗性，尤其是牛筋草已经在我国南方免耕种植区、种植园成为优势杂草和恶性杂草，其抗性蔓延日趋严重，成为难以解决的问题。
抗药性问题是无可避免的，即使是被捧上神坛的草甘膦，也得直面这一困境。雪上加霜的是，草甘膦还经受着产能过剩、价格波动、负面新闻缠绕等阵痛。草甘膦致癌的新闻不时见诸媒体，同时遭受世界卫生组织、欧美检测机构的质疑。草甘膦价格时有波动，国内大小厂家狭路相逢，竞相价格战以获得市场，为降低成本而减少环保支出的行为数见不鲜。目前，多有呼声认为，在百草枯被禁限的情况下，草甘膦因为如上劣势，在争夺空白市场的竞争中，可能不敌草铵膦。
然而，刘长令认为，草铵膦无法打败草甘膦，从成本来考虑，一吨草甘膦价格大约在2万，一吨草铵膦价格大约在15万——草铵膦的推广，价格上的差距就是一道无法跨越的鸿沟。
草甘膦所面临的核心问题，是抗药性。因着草甘膦的高效、低价、人体代谢快等优势，草甘膦距离被市场自由淘汰尚且有很长一段时间。针对草甘膦的抗药性问题，目前混配使用是一个不错的对策。
与茎叶处理除草剂的混用
草甘膦对一些多年生草如苣荬菜、飞廉、问荆等的防效不理想。在生产上与苯氧羧酸类除草剂如2,4-滴等混用。这样既可以提高杂草防效，也解决了难防杂草问题。不仅对小飞蓬等恶性杂草防治效果好，而且能提高对莎草、阔叶杂草防治效果。
与土壤处理除草剂的混用
草甘膦的土壤活性较低，只能有效防除出土的杂草。而生产上的杂草一般是点片、陆续发生，不断造成危害。针对这一个问题，可以将草甘膦与一些土壤处理活性高的除草剂混用。这样“一杀一封”既能显著延长除草剂的持效期，又可以节约重复施药成本，减轻杂草危害。
