香蕉的水分管理是获得优质高产的重要环节之一。水分不仅影响香蕉植株的生长发育，也影响到根的生长及对矿质营养元素的吸收。可以说，香蕉栽培中肥多肥少，只是产量高些低些；而水分过多或过少，则可能使香蕉失收。故水分的管理应该比施肥管理重要些，这一点往往被多数人忽视。
香蕉不同的生长期，对水分的敏感程度不同，最敏感期是抽蕾期。如抽蕾期水分过多或过少，则对果实的产量和质量影响十分重大。而苗期轻微干旱，则只影响生育期。一般花芽分化期至幼果期水分充足，而挂果中后期适当的控水，有利于提高果实的品质风味和耐贮性。
香蕉的需水量较大，土壤水分不足对生长影响很大，但香蕉的根为肉质根，土壤水分过多又会影响其透气性，对根的生长和吸收不利，这一点是香蕉水分管理的困难之处。
我国蕉区的雨量分布极不均匀，夏季常雨量过多，秋季则有时雨量过多造成涝害，有时又过少造成短时干旱。
雨季涝害及排水
雨季如连续几天至十几天下雨，使地下水位低的坡地山地蕉园的土壤经常处于渍水状态，土壤氧气缺乏，危及根的活动和寿命。而地势低，地下水位高又排水不良的蕉园，雨量过大则会发生浸水。有些河边、海边的围田蕉园，还会受堤坝崩溃时外来水的浸泡。
雨季多在高温期，香蕉处于旺盛生长期，高温曝晒又会加剧涝害的危害，涝害造成的损失是十分大的，有时比风害、冷害更严重。
土壤排水不良的检查，可挖蕉园的土壤，观察其犁底层下褐斑氧化层的深度，褐斑氧化层深甚至没有的，说明土壤排水性良好。旱田、旱地蕉园要注重土壤的内部排水性。水田蕉园的渍水和浸水在雨季经常发生，既要注重土壤的外部排水性，也要注重内部排水性。由于涝害比旱害更严重，蕉园排水不良，导致根系腐烂，肥伤，使叶片早衰，果实树上成熟，使产量下降，品质降低。
内地势低、经常浸水的地方，要筑牢固的防水坝，并配备相当排水量的抽水机以防涝。蕉园要搞好3级排水沟，保证地下水位能降至1米以下。内部排水性较差的土壤，要用一畦一行的整地种植方式。对于旱田、旱地蕉园的排水，主要是根据土壤的排水性来整地，砂质土壤可起浅畦，而土壤较粘重的畦沟则要深些，并以一畦一行的整地法种植，有利于排水。
强降雨天气，造成蕉园内涝灾害，受浸时间长，雨后突晴暴晒，致使蕉株水分供求失去平衡，严重影响了香蕉的生长，易引起植株的凋谢枯萎，直接导致经济损失。为把灾害造成的损失降到最低，根据香蕉的不同涝害程度提出如下处理意见：
1、对处于营养生长期，涝害程度相对较轻的蕉园，要加强管理，促进植株尽快恢复生长，主要措施是：
（1）创造一个加快根系恢复生长的环境条件。土壤板结的，可进行适当的浅耕松土，恢复土壤的通透性，促发新根；在植株周围用蕉叶等进行覆盖，干旱时早晚适当灌、淋水，保持土层湿润。
（2）及时防治病虫害。重点是抓好叶斑病的防治，可用倍敌脱、上星等杀菌剂防治；同时结合防病进行叶面追肥，加强营养，促进香蕉恢复生长。
（3）及时清园，割除下部枯叶。
（4）植株萌发新根后应抓紧追肥，在施肥上要适量，不能偏重、过量，同时要氮、磷、钾配合施用。
2、对于已抽蕾结果，涝害程度较轻，并且还保持有一定数量的青叶数的植株，视具体情况适当减少挂果数量，一般每弓蕉保留4～6梳，以便有足够的营养供应蕉果发育膨大。
3、对受浸时间长、根系腐烂、植株凋萎死亡的蕉园。分二类情况处理：
（1）如果是新植蕉，砍掉失去经济价值的植株，让吸芽早生快发。
（2）如果是旧头蕉，建议迅速清园，进行土壤消毒后，改种短期经济作物（如甜玉米、蔬菜等），待明年才重新种植香蕉。
